土地证50年权限到期了，使用权人可以继续缴纳商铺的土地出让金，重新取得房屋土地使用权。50年权限到期的只是土地租用时间，因此到期后只要继续缴纳土地出让金，即可重新取得房屋土地使用权。
法律依据：
《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十二条
土地使用权出让最高年限按下列用途确定：
（一）居住用地七十年；
（二）工业用地五十年；
（三）教育、科技、文化、卫生、体育用地五十年；
（四）商业、旅游、娱乐用地四十年；
（五）综合或者其他用地五十年。