违规征地政府败诉的惩罚有：由政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，违反土地利用总体规划的限期拆除、恢复土地原状，符合土地利用总体规划的没收占地建筑物、可以并处每平方米30元以下的罚款。
法律依据：
《土地管理法》第七十七条
未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。