农村违章建筑强拆程序是首先立案进行调查，确属于违章建筑的，责令改正，停止施工；然后逾期不改正的，可以作出拆除的行政处罚决定书，送达当事人，再按照处罚决定在期限内予以拆除。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》第七十八条
农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。超过省、自治区、直辖市规定的标准，多占的土地以非法占用土地论处。
《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条
在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。