关于宅基地转让协议是否有效问题，同样需要区分具体情形，一般而言，如果交易双方都是同一集体经济组织内部成员，也没有违反地方有关限制性规定的情形，协议原则上是有效的；
如果交易双方不属于同一集体经济组织，在没有特殊规定的前提下，那么协议原则上是无效的。
【法律依据】
《土地管理法》第六十二条，农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。
国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。
国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。